Dalam rangka pendidikan karakter siswa, MAN Kota Blitar menyediakan Pondok Pesantren Putra-Putri “Nurul Iman”. Pondok pesantren ini di khususkan untuk siswa siswi MAN Kota Blitar yang asal daerahnya jauh dari MAN Kota Blitar.

Dengan kegiatan yang terjadwal diharapkan santri bisa menjadi figur yang disiplin dan bertanggung jawab. Kegiatan di Pondok Pesantren dimulai pukul 17.00 sampai dengan pukul 21.00.

Selain kegiatan rutin berupa sholat jama’ah dan penambahan materi kitab kuning serta pendalaman materi UN, santri juga dikelompokkan ke dalam peminatan qiroatul kutub dan program tahfidh.

Sebagai penambah kegiatan santri juga mengikuti berbagai pelatihan yang bekerjasama dengan berbagai pihak.